workflows.smri.ants.antsRegistrationBuildTemplate

antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF()

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Inputs:

inputspec.images :
inputspec.fixed_image :
inputspec.ListOfPassiveImagesDictionaries :
inputspec.interpolationMapping :

Outputs:

outputspec.template :
outputspec.transforms_list :
outputspec.passive_deformed_templates :

Graph

digraph antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF_{ label="antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF_"; antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__inputspec[label="inputspec (utility)"]; antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__99_GetMovingImagesNode[label="99_GetMovingImagesNode (utility)"]; antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__99_GetPassiveImagesNode[label="99_GetPassiveImagesNode (utility)"]; antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__BeginANTS[label="BeginANTS (ants)"]; antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__99_FlattenTransformAndImagesList[label="99_FlattenTransformAndImagesList (utility)"]; antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__wimtdeformed[label="wimtdeformed (ants)"]; antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__AvgDeformedImages[label="AvgDeformedImages (ants)"]; antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__wimtPassivedeformed[label="wimtPassivedeformed (ants)"]; antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__99_SplitAffineAndWarpsNode[label="99_SplitAffineAndWarpsNode (utility)"]; antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__AvgAffineTransform[label="AvgAffineTransform (ants)"]; antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__AvgWarpImages[label="AvgWarpImages (ants)"]; antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__GradientStepWarpImage[label="GradientStepWarpImage (ants)"]; antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__UpdateTemplateShape[label="UpdateTemplateShape (ants)"]; antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__99_MakeTransformListWithGradientWarps[label="99_MakeTransformListWithGradientWarps (utility)"]; antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__ReshapeAverageImageWithShapeUpdate[label="ReshapeAverageImageWithShapeUpdate (ants)"]; antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__99_RenestDeformedPassiveImages[label="99_RenestDeformedPassiveImages (utility)"]; antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__AvgDeformedPassiveImages[label="AvgDeformedPassiveImages (ants)"]; antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__ReshapeAveragePassiveImageWithShapeUpdate[label="ReshapeAveragePassiveImageWithShapeUpdate (ants)"]; antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__outputspec[label="outputspec (utility)"]; antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__inputspec -> antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__BeginANTS; antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__inputspec -> antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__wimtdeformed; antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__inputspec -> antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__99_GetMovingImagesNode; antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__inputspec -> antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__99_GetMovingImagesNode; antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__inputspec -> antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__99_GetMovingImagesNode; antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__inputspec -> antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__99_RenestDeformedPassiveImages; antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__inputspec -> antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__99_FlattenTransformAndImagesList; antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__inputspec -> antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__99_GetPassiveImagesNode; antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__inputspec -> antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__99_GetPassiveImagesNode; antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__99_GetMovingImagesNode -> antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__BeginANTS; antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__99_GetMovingImagesNode -> antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__BeginANTS; antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__99_GetMovingImagesNode -> antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__wimtdeformed; antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__99_GetPassiveImagesNode -> antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__99_FlattenTransformAndImagesList; antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__BeginANTS -> antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__99_FlattenTransformAndImagesList; antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__BeginANTS -> antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__99_FlattenTransformAndImagesList; antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__BeginANTS -> antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__wimtdeformed; antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__BeginANTS -> antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__wimtdeformed; antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__BeginANTS -> antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__99_SplitAffineAndWarpsNode; antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__99_FlattenTransformAndImagesList -> antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__wimtPassivedeformed; antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__99_FlattenTransformAndImagesList -> antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__wimtPassivedeformed; antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__99_FlattenTransformAndImagesList -> antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__wimtPassivedeformed; antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__99_FlattenTransformAndImagesList -> antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__wimtPassivedeformed; antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__99_FlattenTransformAndImagesList -> antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__99_RenestDeformedPassiveImages; antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__wimtdeformed -> antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__AvgDeformedImages; antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__AvgDeformedImages -> antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__wimtPassivedeformed; antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__AvgDeformedImages -> antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__UpdateTemplateShape; antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__AvgDeformedImages -> antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__ReshapeAverageImageWithShapeUpdate; antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__AvgDeformedImages -> antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__ReshapeAverageImageWithShapeUpdate; antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__wimtPassivedeformed -> antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__99_RenestDeformedPassiveImages; antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__99_SplitAffineAndWarpsNode -> antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__AvgAffineTransform; antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__99_SplitAffineAndWarpsNode -> antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__AvgWarpImages; antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__AvgAffineTransform -> antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__UpdateTemplateShape; antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__AvgAffineTransform -> antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__99_MakeTransformListWithGradientWarps; antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__AvgWarpImages -> antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__GradientStepWarpImage; antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__GradientStepWarpImage -> antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__UpdateTemplateShape; antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__UpdateTemplateShape -> antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__99_MakeTransformListWithGradientWarps; antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__99_MakeTransformListWithGradientWarps -> antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__ReshapeAverageImageWithShapeUpdate; antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__99_MakeTransformListWithGradientWarps -> antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__ReshapeAveragePassiveImageWithShapeUpdate; antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__ReshapeAverageImageWithShapeUpdate -> antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__outputspec; antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__99_RenestDeformedPassiveImages -> antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__AvgDeformedPassiveImages; antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__99_RenestDeformedPassiveImages -> antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__AvgDeformedPassiveImages; antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__99_RenestDeformedPassiveImages -> antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__ReshapeAveragePassiveImageWithShapeUpdate; antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__99_RenestDeformedPassiveImages -> antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__ReshapeAveragePassiveImageWithShapeUpdate; antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__AvgDeformedPassiveImages -> antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__ReshapeAveragePassiveImageWithShapeUpdate; antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__AvgDeformedPassiveImages -> antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__ReshapeAveragePassiveImageWithShapeUpdate; antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__ReshapeAveragePassiveImageWithShapeUpdate -> antsRegistrationTemplateBuildSingleIterationWF__outputspec; }

FlattenTransformAndImagesList()

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GetFirstListElement()

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GetMovingImages()

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This currently ONLY works when registrationImageTypes has length of exactly 1. When the new multi-variate registration is introduced, it will be expanded.

GetPassiveImages()

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MakeTransformListWithGradientWarps()

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RenestDeformedPassiveImages()

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SplitAffineAndWarpComponents()

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makeListOfOneElement()

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